Кольцово с 1993 участвует в наукоградном движении, являясь членом Ассоциации наукоградов. Перед наукоградами ставится задача полнее использовать свой материальный, ресурсный, кадровый потенциал для обеспечения устойчивого экономического развития. Городом был выигран международный двухгодичный грант, он стал участником международного проекта "Инновационные центры и наукограды", проводимого под эгидой Европейского Союза.
В рамках проекта город получил возможность изучить опыт обустройства научных городков в Англии, Франции, Германии, Австрии и других странах. Создав инновационный центр, власти Кольцова активно занялись доходной базой, развитием и поддержкой малого бизнеса на своей территории. После получения городом статуса наукограда и подписания соглашение о реализации программы его развития с правительством, с губернатором, власти Кольцова второй год претворяют эту программу в жизнь. Как отметил мэр города Н.Красников, в 2004 году была утверждена нормативно-правовая база, которая обеспечивает четкие и привлекательные условия для наукоемких фирм на территории города. Это и прямые гранты, и льготные 2% кредиты, и снижение ставки кредитного процента, и налоговые льготы, льготная арендная плата, выделение земельных участков под строительство офисов.
Инновационный центр города развивается, помогает находить новые формы сотрудничества. Уже установлены побратимские связи с г.Пиза (Италия) в области поддержки малого и среднего бизнеса. Активно идет работа вместе с Европейским Союзом по созданию виртуального бизнес-инкубатора, электронного магазина, где можно познакомиться с новыми идеями и найти новых инвесторов.